La vita persiste nell’oscurità profonda e fredda, e “ovunque ci sia vita, puoi scommettere che ci sono regolatori al lavoro”, ha detto il virologo marino Min Wang, Ph.D, dell’Università Oceanica della Cina, a Qingdao. “Virus, in questo caso.”
Il virus proveniente dalle profondità
Questa settimana su Microbiology Spectrum, Wang e un gruppo internazionale di ricercatori riportano la scoperta di un nuovo virus isolato da sedimenti estratti da una profondità di 8.900 metri.
Il virus è un batteriofago, o un virus che infetta e si replica all’interno dei batteri, e si ritiene che i batteriofagi siano le forme di vita più abbondanti del pianeta. “Per quanto ne sappiamo, questo è il fago isolato più profondo conosciuto nell’oceano globale”, ha detto Wang.
Il fago appena scoperto infetta i batteri del phylum Halomonas
Questi batteri si trovano spesso nei sedimenti delle profondità marine e nei boccaporti idrotermali, aperture simili a geyser sul fondo marino che rilasciano correnti di acqua calda. Wang ha detto che l’analisi del gruppo del materiale genetico virale indica l’esistenza di una famiglia virale precedentemente sconosciuta nelle profondità dell’oceano, così come nuove conoscenze sulla diversità, evoluzione e caratteristiche genomiche dei fagi delle profondità marine e le interazioni fago-ospite.
Studi precedenti e nuove scoperte
In precedenti lavori, i ricercatori hanno utilizzato analisi metagenomiche per studiare i virus che infettano i batteri dell’ordine Oceanospirallales, che include Halomonas. Per il nuovo studio, il team di Wang ha cercato virus in ceppi batterici raccolti e isolati da un team guidato dal virologo marino Yu-Zhong Zhang, Ph.D, anch’egli dell’Università Oceanica della Cina, a Qingdao. La ricerca di Zhang esplora la vita microbiana in ambienti estremi, tra cui le regioni polari e la Fossa delle Marianne.
Analisi genomica del nuovo virus
L’analisi genomica del nuovo virus, identificato come vB_HmeY_H4907, suggerisce che è ampiamente distribuito nell’oceano e ha una struttura simile a quella del suo ospite. Wang ha detto che lo studio solleva nuove domande e aree di ricerca incentrate sulle strategie di sopravvivenza dei virus in ambienti ostili e isolati e su come evolvono insieme ai loro ospiti. Il nuovo virus è lisogenico, il che significa che invade e si replica all’interno del suo ospite, ma generalmente senza uccidere la cellula batterica. Man mano che la cellula si divide, il materiale genetico virale viene anche copiato e trasmesso.
Studi futuri
In futuri studi, ha detto Wang, il gruppo prevede di indagare la macchina molecolare che guida le interazioni tra i virus delle profondità marine e i loro ospiti. Stanno anche cercando altri nuovi virus in luoghi estremi, “che contribuirebbero ad ampliare la nostra comprensione della virosfera”, ha detto Wang. “Gli ambienti estremi offrono prospettive ottimali per scoprire nuovi virus”.
Riferimento
Identificazione e analisi genomica del batteriofago temperato Halomonas vB_HmeY_H4907 dal sedimento superficiale della Fossa delle Marianne ad una profondità di 8.900 m. Yue Su et al. 2023. American Society for Microbiology, Microbiology Spectrum.
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.01912-23
